เนื่องจาก ศูนย์พัฒนาเด็กเล็กฯ เป็นสถานที่ที่เด็กอยู่ร่วมกันเป็นจำนวนมาก เมื่อเกิดการเจ็บป่วยจะแพร่เชื้อโรค ติดต่อสู่เด็กคนอื่นได้ง่าย เพราะเด็กเล็กมีภูมิต้านทานต่ำจะป่วยบ่อย โรคที่พบบ่อย ได้แก่ โรคติดเชื้อทางเดินหายใจ โรคมือ เท้า ปาก เหาในเด็กเล็ก เป็นต้น ส่งผลกระทบต่อพัฒนาการสุขภาพโดยรวมของเด็ก ซึ่งหากเด็กเจ็บป่วยจะส่งผลกระทบต่อการเรียนของเด็กนั้น ดังนั้น ศูนย์พัฒนาเด็กเล็กเทศบาลนครรังสิต (เทพธัญญะอุปถัมภ์) เล็งเห็นความสำคัญต่อสุขภาพของเด็กก่อนวัยเรียนในช่วงอายุ 2 ปี ซึ่งเป็นวัยที่มีภูมิคุ้มกันต่ำ จึงของบประมาณสนับสนุนจากกองทุนหลักประกันสุขภาพเทศบาลนครรังสิต เพื่อดำเนินโครงการการปลอดโรคโรงเรียนนครรังสิต เทพธัญญะอุปถัมภ์ ขึ้น